Aun que considero que es más fácil construir el cubo de la segunda manera, la propiedad transform-origin también acepta valores para el eje Z. En el ejemplo concreto del vídeo se podía haber colocado un transform-origin: 150px 150px -150px; y también funciona, el único detalle es que no funciona con porcentajes o palabras clave como center, tienen que ser medidas concretas.